Презентация на тему: Спектроскопия кругового дихроизма

Спектроскопия кругового дихроизма
Спектроскопия кругового дихроизма
Спектроскопия кругового дихроизма
Спектроскопия кругового дихроизма
Поляризация света
Спектроскопия кругового дихроизма
Эллиптичность
Численное выражение
Поглощение и КД
Ближний/дальний УФ
Вторичная структура
Вторичная структура
Вторичная структура
Спектроскопия кругового дихроизма
Вторичная структура
Вторичная структура
Моделирование спектров
Конформационное состояние белка
Примеры использования
Амилоидные структуры
Третичная структура
Примеры использования
Третичная структура
Третичная структура
Нуклеиновые кислоты
Нуклеиновые кислоты
Спектроскопия кругового дихроизма
1/27
Средняя оценка: 4.6/5 (всего оценок: 86)
Код скопирован в буфер обмена
Скачать (2825 Кб)
1

Первый слайд презентации: Спектроскопия кругового дихроизма

к.б.н. Павел Семенюк отдел физических методов измерений НИИ ФХБ им. А.Н. Белозерского МГУ

Изображение слайда
2

Слайд 2

Изображение слайда
3

Слайд 3

Изображение слайда
4

Слайд 4

4

Изображение слайда
5

Слайд 5: Поляризация света

5

Изображение слайда
6

Слайд 6

6 Оптическая активность

Изображение слайда
7

Слайд 7: Эллиптичность

7 Линейно поляризованный свет Эллиптично поляризованный свет

Изображение слайда
8

Слайд 8: Численное выражение

8 ε L ε R θ Молярный дихроизм: Молярная эллиптичность: Нормируют на моль а.о.

Изображение слайда
9

Слайд 9: Поглощение и КД

9

Изображение слайда
10

Слайд 10: Ближний/дальний УФ

10 400 нм 7 00 нм ИК Ультрафиолет Ближний УФ – 250.. 320 нм Дальний УФ – 190.. 260 нм II структура III структура

Изображение слайда
11

Слайд 11: Вторичная структура

11 Greenfield, N.; Fasman, G. D. Biochemistry 1969, 8, 4108–4116. α - спираль: β - структура: 216 нм 208 нм 220 нм

Изображение слайда
12

Слайд 12: Вторичная структура

12 Greenfield, N.; Fasman, G. D. Biochemistry 1969, 8, 4108–4116. α - спираль: 208 нм 220 нм

Изображение слайда
13

Слайд 13: Вторичная структура

13 Greenfield, N.; Fasman, G. D. Biochemistry 1969, 8, 4108–4116. α - спираль: 208 нм 220 нм

Изображение слайда
14

Слайд 14

14 α - спираль β - поворот β - лист polyPro random coil –200 нм –190 нм +210..230 нм –216 нм +195 нм –208 и –222 нм +192 нм –180..190 нм –220..230 нм +205 нм

Изображение слайда
15

Слайд 15: Вторичная структура

15 3 10 - спираль Вторичная структура α - спираль:

Изображение слайда
16

Слайд 16: Вторичная структура

16 Зависимость спектра от длины α -спирали длина волны эллиптичность

Изображение слайда
17

Слайд 17: Моделирование спектров

17 Perez-Iratxeta, C.; Andrade-Navarro, M. A. BMC Structural Biology 2008, 8, 25. CDPro Sreerama, N.; Venyaminov, S. Y.; Woody, R. W. Protein Sci 1999, 8, 370–380.

Изображение слайда
18

Слайд 18: Конформационное состояние белка

18 Uversky, V. N.; Fink, A. L. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics 2004, 1698, 131–153. Native Molten globule Natively unfolded (MG) Natively unfolded (Random Coil) Amyloid

Изображение слайда
19

Слайд 19: Примеры использования

19 Iacobucci, V.; Di Giuseppe, F.; Bui, T. T.; Vermeer, L. S.; Patel, J.; Scherman, D.; Kichler, A.; Drake, A. F.; Mason, A. J. Biochim Biophys Acta 2012, 1818, 1332–1341.

Изображение слайда
20

Слайд 20: Амилоидные структуры

20 Starck, C. S.; Sutherland-Smith, A. J. PLoS One 2010, 5. Myostatin precursor protein Амилоидные олигомеры и фибриллы

Изображение слайда
21

Слайд 21: Третичная структура

21 Триптофан – 290.. 305 нм Тирозин – 275.. 282 нм Фенилаланин – 255.. 270 нм Зависит от окружения! Нуклеиновые кислоты состоят из ароматических мономеров

Изображение слайда
22

Слайд 22: Примеры использования

22 Точечные мутации Krell, T. et al. J. Biol. Chem. 1996, 271, 24492–24497.

Изображение слайда
23

Слайд 23: Третичная структура

23 Связывание с красителем вызывает конформационные перестройки Ghosh, U.; Das, M.; Dasgupta, D. Biopolymers 2003, 72, 249–255. ANS

Изображение слайда
24

Слайд 24: Третичная структура

24 Nemykh, M. A.; Novikov, V. K.; Arutiunian, A. M.; Kalmykov, P. V.; Drachev, V. A.; Dobrov, E. N. Mol. Biol. (Mosk.) 2007, 41, 697–705.

Изображение слайда
25

Слайд 25: Нуклеиновые кислоты

25

Изображение слайда
26

Слайд 26: Нуклеиновые кислоты

26 Лиганд + Квадруплекс ДНК Rahman, K. M.; Corcoran, D. B.; Bui, T. T. T.; Jackson, P. J. M.; Thurston, D. E. PLoS ONE 2014, 9, e105021.

Изображение слайда
27

Последний слайд презентации: Спектроскопия кругового дихроизма

27 Удобный и доступный метод исследования структуры белка – как третичной, так и вторичной Неразрушающий и достаточно чувствительный Идеален для α -спиральных белков, но хуже подходит для исследования β -структурных белков

Изображение слайда