Презентация на тему: Репарация ДНК

Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
РНК полимераза (прокариоты)
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Транскрипция
1. Транскрипция - синтез РНК ( любых видов ) по матрице ДНК
Матрица
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Основы полимеризации
2.Элонгация – по принципу комплементарности и антипараллельности на матричной цепи ДНК строится РНК- копия
Цепи ДНК
Консервативные последовательности
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
Репарация ДНК
3. Терминация. Сигналом для этого служит образование «шпильки» на РНК, при этом РНК отсоединяется от ДНК
1/42
Средняя оценка: 4.2/5 (всего оценок: 86)
Код скопирован в буфер обмена
Скачать (2980 Кб)
1

Первый слайд презентации

Репарация ДНК

Изображение слайда
2

Слайд 2

Репарация – устранение из ДНК повреждений. Репарации делят по механизму на три группы – фотореактивация, эксцизионная репарация и пострепликативня репарация. Два последних – темновая репарация. Фотореактивация заключается в восстановлении ДНК, поврежденной ультрафиолетом, при воздействии видимого света. При действии УФ образуются димеры тимина, с которыми специфически связывается фермент дезоксирибопиримидинфотолиаза. На свету происходит мономеризация димеров.

Изображение слайда
3

Слайд 3

Эксцизионная репарация – димеры тимина и другие повреждения узнаются ферментом УФ-эндонуклеазой, которая разрывает фосфодиэфирную связь с 5-штрих конца димера. Затем другая нуклеаза вырезает короткий олигонуклеотид (3-5 осгований) с поврежденным участком. Образуя бреши в ДНК. Затем ДНК-полимераза заполняет брешь, лигаза сшивает.

Изображение слайда
4

Слайд 4

Изображение слайда
5

Слайд 5

Пострепликативная (рекомбинационная) репарация. Репарация этого типа не происходит в клетках, дефектных по рекомбинации. Происходит быстро, в первые минуты после облучения УФ. Тиминовые димеры остаются в исходной ДНК. Разновидностью этого типа репараций является SOS -репарация, в которой задействованы белки LexA и RecA. Индукция происходит при появлении лдноцепочечных поврежденных участков. К ним присоединяется RecA, образуя микрофиламенты, с ними взаимодействует LexA, который аутопротеолитически расщепляется в середине полипептидной цепи, утрачивая репрессорную активность в отношении RecA и других белков SOS- регулона (гены umuC umuD), необходимых для репликации ДНК в обход повреждений.

Изображение слайда
6

Слайд 6

Изображение слайда
7

Слайд 7

Изображение слайда
8

Слайд 8

Изображение слайда
9

Слайд 9

МР4 Репарация ДНК

Изображение слайда
10

Слайд 10

Транскрипция

Изображение слайда
11

Слайд 11: РНК полимераза (прокариоты)

Изображение слайда
12

Слайд 12

Эукариотические РНК полимеразы РНК-полимераза I, синтезирующая рРНК. РНК-полимераза II, производящая предшественников для мРНК, а также для большинства мяРНК и миРНК РНК-полимераза III, синтезирующая тРНК, 5S рРНК и другие малые РНК.

Изображение слайда
13

Слайд 13

ТРАНСКРИПЦИЯ процесс синтеза РНК с использованием ДНК в качестве матрицы, происходящий во всех живых клетках ДНК-зависим ая РНК-полимераз а направлени е: от 5'- к 3'- концу Из Кольман, Рем «Наглядная биохимия» транскрипция

Изображение слайда
14

Слайд 14

РНК-полимераза E.coli Белок с четвертичной структурой: Holo- фермент (полный) состоит из 5 субъединиц – ααββγ. Без γ – это core -фермент. γ узнает расплавленные области промотора. Holo- фермент связывается с промотором и начинает транскрипцию после этого γ уходит и далее элонгацию осуществляет core -фермент

Изображение слайда
15

Слайд 15

РНК-полимераза У бактерий один и тот же фермент катализирует синтез трех типов РНК: мРНК, рРНК и тРНК. РНК-полимераза — крупная молекула. Состоит из пяти субъединиц (~400 кДа): α2ββ'ω (корфермент) Для связывания с промоторными областями ДНК необходима еще одна субъединица — сигма (σ). Сигма-фактор значительно снижает сродство РНК-полимеразы к неспецифичным областям ДНК, и повышает ее чувствительность к определенным промоторам. С его помощью транскрипция начинается с нужного участка ДНК http://bio.fizteh.ru

Изображение слайда
16

Слайд 16

Изображение слайда
17

Слайд 17

Изображение слайда
18

Слайд 18

Изображение слайда
19

Слайд 19

Изображение слайда
20

Слайд 20

Изображение слайда
21

Слайд 21

Изображение слайда
22

Слайд 22

Изображение слайда
23

Слайд 23: Транскрипция

Изображение слайда
24

Слайд 24: 1. Транскрипция - синтез РНК ( любых видов ) по матрице ДНК

В качестве матричной выступает цепь ДНК 3 ’  5’. Цепь 5’  3’ в транскрипции не участвует. Эту цепь называют кодогенной, т.к. последовательность нуклеотидов РНК (кодонов) совпадает с ее последовательностью

Изображение слайда
25

Слайд 25: Матрица

Изображение слайда
26

Слайд 26

В бактериях транскрипцию катализирует единственная РНК-полимераза. Она состоит из основной части из пяти субъединиц (α 2 ββ'ω) и σ-субъединицы (сигма-фактор), которая определяет связывание с промотором и является единственным фактором инициации транскрипции. У  Escherichia coli, например, самая распространенная форма сигма-фактора — σ. Клетки эукариот содержат как минимум 3  РНК-полимеразы, а растения — 5, которые для инициации и элонгации требуют набора факторов.  РНК-полимераза II  — основной фермент эукариотических клеток, катализирующий транскрипцию белок-кодирующих  мРНК  (и некоторых других РНК). В бактериях, мРНК после транскрипции никак не модифицируется, и непосредственно во время транскрипции может происходить  трансляция. В эукариотических клетках мРНК модифицируется в ядре — на неё навешивается 5'-кэп и синтезируется 3'-полиА-хвост, происходит  сплайсинг. Затем мРНК может попасть в цитоплазму, где будет происходит трансляция.

Изображение слайда
27

Слайд 27

Терминация транскрипции У бактерий есть два механизма терминации транскрипции: ро-зависимый механизм, при котором белок  Rho  ([ро]) дестабилизирует водородные связи между матрицей  ДНК  и  мРНК, высвобождая молекулу РНК. ро-независимый, при котором транскрипция останавливается, когда только что синтезированная молекула РНК формирует  стебель-петлю, за которой расположено несколько  урацилов  (…УУУУ), что приводит к отсоединению молекулы РНК от матрицы ДНК. Терминация транскрипции у эукариот менее изучена. Она завершается разрезанием РНК, после чего к её 3' концу фермент добавляет несколько  аденинов  (…АААА), от числа которых зависит стабильность данного транскрипта.

Изображение слайда
28

Слайд 28

Изображение слайда
29

Слайд 29

-10 -35 Кор-фермент  2   2 TATAAT  4  3  1 TTGACA TATAAT  2 РНК-полимераза бактерий Холофермент Основные элементы промотора (-10 и -35) узнаются  -субъединицей Плавление ДНК осуществляется за счет контактов  -субъединицы с нематричной цепью ДНК в районе старта транскрипции

Изображение слайда
30

Слайд 30: Основы полимеризации

Изображение слайда
31

Слайд 31: 2.Элонгация – по принципу комплементарности и антипараллельности на матричной цепи ДНК строится РНК- копия

кодогенная цепь матричная цепь ц А У Г Ц У Ц

Изображение слайда
32

Слайд 32: Цепи ДНК

Изображение слайда
33

Слайд 33: Консервативные последовательности

Изображение слайда
34

Слайд 34

Единица транскрипции эукариот – ГЕН (участок ДНК, структурная и функциональная единица наследственности) Ген включает: Начало транскрипции – промотор. Конец транскрипции - терминатор. Другие регуляторные последовательности – которые могут находиться как в непосредственной близости от места транскрипции, так и на значительном удалении от места транскрипции Из Кольман, Рем «Наглядная биохимия»

Изображение слайда
35

Слайд 35

РНК-полимераза У бактерий один и тот же фермент катализирует синтез трех типов РНК: мРНК, рРНК и тРНК. РНК-полимераза — крупная молекула. Состоит из пяти субъединиц (~400 кДа): α2ββ'ω (корфермент) Для связывания с промоторными областями ДНК необходима еще одна субъединица — сигма (σ). Сигма-фактор значительно снижает сродство РНК-полимеразы к неспецифичным областям ДНК, и повышает ее чувствительность к определенным промоторам. С его помощью транскрипция начинается с нужного участка ДНК http://bio.fizteh.ru

Изображение слайда
36

Слайд 36

Транскрипционный цикл Регуляторные факторы действуют на всех стадиях транскрипции Терминация Инициация Элонгация

Изображение слайда
37

Слайд 37

Этапы транскрипции Clancy, S. (2008) DNA transcription. Nature Education 1(1) Инициация Элонгация Терминация

Изображение слайда
38

Слайд 38

Промотор Последовательность нуклеотидов ДНК – опознается РНК-полимеразой как знак начала транскрипции Clancy, S. (2008) DNA transcription. Nature Education 1(1)

Изображение слайда
39

Слайд 39

Прокариотические промоторы Различающиеся последовательности! Сильный промотор инициирует синтез мРНК часто, слабый - гораздо реже. Промоторы шести разных генов E. coli 2005 W. H. Freeman Pierce, Benjamin. Genetics: A Conceptual Approach, 2nd ed. (New York: W. H. Freeman and Company), 357

Изображение слайда
40

Слайд 40

Инициация транскрипции http://bio.fizteh.ru

Изображение слайда
41

Слайд 41

Элонгация транскрипции Движение РНК-полимеразы по матрице со скоростью около 30 нуклеотидов в сек: впереди - происходит расплетание, а позади — восстановление двойной спирали ДНК. Одновременно освобождается очередное звено растущей цепи РНК из комплекса с матрицей и РНК-полимеразой. Высокая частота ошибок – 1 на 10 4 нуклеотидов, т.е. на пять порядков выше, чем при репликации.

Изображение слайда
42

Последний слайд презентации: Репарация ДНК: 3. Терминация. Сигналом для этого служит образование «шпильки» на РНК, при этом РНК отсоединяется от ДНК

РНК Сигнал терминации Самопроизвольное сворачивание «шпилька»

Изображение слайда