Презентация на тему: Обработка результатов гель-электрофореза

Обработка результатов гель-электрофореза
План:
Анализ результатов гель-электрофореза
Анализ результатов гель-электрофореза
Пакеты бесплатного программного обеспечения
Программный комплекс ImageJ
Программный комплекс ImageJ
Основное окно программы ImageJ
Возможности программы
Электронные ресурсы
1/10
Средняя оценка: 4.8/5 (всего оценок: 13)
Код скопирован в буфер обмена
Скачать (2037 Кб)
1

Первый слайд презентации: Обработка результатов гель-электрофореза

Лабораторная работа №6 по «Генетике микроорганизмов» Министерство образования и науки Российской Федерации Федеральное бюджетное государственное образовательное учреждение высшего образования « Оренбургский государственный университет» Химико-биологический факультет Кафедра биохимии и микробиологии Давыдова Ольга Константиновна, к.б.н., доцент

Изображение слайда
2

Слайд 2: План:

Анализ результатов гель-электрофореза Программное обеспечение для анализа и обработки изображений Программный комплекс ImageJ

Изображение слайда
3

Слайд 3: Анализ результатов гель-электрофореза

Можно выделить три основных метода детекции результатов электрофореза: При визуальном методе гель просматривают непосредственно в УФ, субъективно оценивая результат При фотографическом методе полученный гель фотографируют, проводя дальнейшую диагностику по фотоснимкам При цифровом методе изображения гелей получают с помощью цифрового фотоаппарата с последующим вводом в компьютер. Метод позволяет получать изображения в реальном времени, использовать цифровую обработку изображений, а также автоматизировать процесс определения количественных показателей (напр., количество и размер ДНК в полосе свечения) и диагностики, осуществлять ведение базы данных

Изображение слайда
4

Слайд 4: Анализ результатов гель-электрофореза

Чувствительность фотографического и цифрового метода детекции сопоставимы и составляют 0,1–1 нг ДНК при окрашивании ЭБ Анализ результатов гель-электрофореза

Изображение слайда
5

Слайд 5: Пакеты бесплатного программного обеспечения

Пакет Описание Интернет-ресурс ImageJ Обработка изображений http://rsbweb.nih.gov/ij OME Базы данных изображений www.openmicroscopy.org Bio-Formats Библиотека обмена метаданными www.loci.wisc.edu/omel CellProfiler Автоматическое вычисление характеристик клеток www.cellprofiler.org VisBio Многофакторный анализ изображений www.loci.wisc.edu/visbio Bisque База данных для семантического анализа www.bioimage.ucsb.edu

Изображение слайда
6

Слайд 6: Программный комплекс ImageJ

Программа ImageJ представляет собой графический редактор, позволяющий производить анализ изображений. 1 2 3

Изображение слайда
7

Слайд 7: Программный комплекс ImageJ

ImageJ позволяет отображать, редактировать, анализировать, обрабатывать, сохранять и печатать 8-битные, 16-битные и 32-битные изображения Комплекс может читать многие форматы изображений, такие как TIFF, PNG, GIF, JPEG, BMP, DICOM, FITS В ImageJ можно вычислять площади, статистические показатели пиксельных значений различных выделенных областей интереса на изображениях, которые выделены вручную. Он может создавать гистограммы плотности и рисовать профили линий. Комплекс позволяет производить различные геометрические преобразования, такие как масштабирование, поворот или отражение

Изображение слайда
8

Слайд 8: Основное окно программы ImageJ

а б в II III I Изображение электрофоретической подвижности препаратов ДНК: а) высокополимерной линейной ДНК, выделенной из молок лосося ( I С N ); б) ДНК фага , расщепленной эндонуклеазой Hind III на линейные фрагменты с фиксированной длиной; в) плазмидной ДНК pUC 19

Изображение слайда
9

Слайд 9: Возможности программы

Примеры выделений Гистограмма изображения Гистограмма изображения в табличном представлении График профиля

Изображение слайда
10

Последний слайд презентации: Обработка результатов гель-электрофореза: Электронные ресурсы

Сообщество разработчиков и пользователей ImageJ http://www.imagej.ru Свободная интернет-энциклопедия https://ru.wikipedia.org/wiki/ImageJ Обзор программы imagej - bioinformatix.ru - портал по биоинформатике, имейджингу и биософту http://www.bioinformatix.ru/analiz-izobrazheniy-imaging-/imagej.html

Изображение слайда