Презентация на тему: 56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция

56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция
1/25
Средняя оценка: 4.4/5 (всего оценок: 8)
Код скопирован в буфер обмена
Скачать (24418 Кб)
1

Первый слайд презентации

56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция экспресии генов на уровне транскрипции и на уровне трансляции. Экспрессия генов – это процесс реализации информации, закодированной в структуре ДНК, на уровне РНК и белков. GUA CGU AAG UAA GU A UG G Инициация трансляции: рамка считывания и код «без запятых» Генетический код: однозначность и вырожденность. тРНК

Изображение слайда
2

Слайд 2

57 CИНТЕЗ РНК ПО ДНК-МАТРИЦЕ Рибонуклеотиды: A, U, C, G РНК-полимераза расплетает дуплекс ДНК в месте транскрипции РНК-транскрипты и матричные ДНК РНК Смысловая цепь (-) Несмысловая цепь (+), матрица

Изображение слайда
3

Слайд 3

58 ДНК-ЗАВИСИМЫЕ РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ РНК-полимераза E. coli Кор-фермент a 2 bb  w Холофермент a 2 bb  w s Thermus aquaticus RNA polymerase holoenzyme

Изображение слайда
4

Слайд 4

59 ДНК-ЗАВИСИМЫЕ РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ «Рабочий цикл» s - субъединицы Участия различных s - субъединиц в споруляции Bacillus subtilis s- факторы E. coli

Изображение слайда
5

Слайд 5

60 ИНИЦИАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ -35 -10 Прибнов-бокс Типичный промотор E.coli Нуклеотидные последовательности смысловой цепи ДНК до сайта инициации транскрипции различных генов E.coli и бактериофагов

Изображение слайда
6

Слайд 6

61 ИНИЦИАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ Связывание холоферментной формы РНК-полимеразы с областью промотора Считается, что белок перекрывает область длиной 50 нуклеотидов, начинающуюся немного раньше -35-последовательности и кончающуюся внутри транскрибируемого участка. Связывание стимулирует расплетание спирали и транскрипцию.

Изображение слайда
7

Слайд 7

62 ИНИЦИАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ Влияние мутаций в -10- и -35-последовательностях на силу промотора +1

Изображение слайда
8

Слайд 8

63 ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ Примеры шпилек в r - независимых и r - зависимых терминаторах транскрипции r - зависимый терминатор r -не зависимые терминаторы GC- богатый участок GC- богатый участок GC- богатый участок Участок из остатков U Участок из остатков U r - ро, rho

Изображение слайда
9

Слайд 9

ρ - НЕЗАВИСИМАЯ ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ 63.5

Изображение слайда
10

Слайд 10

p λ p Δ p58.21 Гасанов Е. В. и др. Мол. генетика, микробиол. и вирусол. 2007. № 2. С. 31-32.

Изображение слайда
11

Слайд 11

64 ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ Влияние r -белка ( фактора) на остановку РНК-полимеразы в терминаторе, сопровождающуюся терминацией транскрипции с отделением фермента и синтезированной РНК r -белок – геликаза, расплетающая дуплекс РНК-ДНК и использующая для этого РНК-зависимый гидролиз АТФ. r -белок движется медленнее, чем РНК-полимераза

Изображение слайда
12

Слайд 12

A Rho factor acts on an RNA substrate. Rho's key function is its  helicase  activity, for which energy is provided by an RNA-dependent ATP hydrolysis. The initial binding site for Rho is an extended (~70 nucleotides, sometimes 80–100 nucleotides) single-stranded region, rich in cytosine and poor in guanine, called the  r ho  ut ilisation site( rut ), in the RNA being synthesised, upstream of the actual terminator sequence. Several rho binding sequences have been discovered. No consensus is found among these, but the different sequences each seem specific, as small mutations in the sequence disrupts its function. Rho binds to RNA and then uses its ATPase activity to provide the energy to translocate along the RNA until it reaches the RNA–DNA helical region, where it unwinds the hybrid duplex structure. RNA polymerase pauses at the termination sequence, which is because there is a specific site around 100 nt away from the Rho binding site called the Rho-sensitive pause site. So, even though the RNA polymerase is about 40 nt per second faster than Rho, it does not pose a problem for the Rho termination mechanism as the RNA polymerase allows Rho factor to catch up.

Изображение слайда
13

Слайд 13

65 ПРОЦЕССИНГ РНК У ПРОКАРИОТ Локализация на хромосомной карте Е. со li семи транскрипционных единиц рРНК. Схематическое представление трех типичных транскрипционных единиц рРНК Е. со li. Указаны кодирующие участки для 5S-, 16S- и 23S-рРНК. молекул тРНК и спейсерные сегменты. Сайты расщепления РНКазой III в предшественниках рРНК. Для расщепления РНКазой III должна сформироваться пространственная структура рРНК.

Изображение слайда
14

Слайд 14

66 ПРОЦЕССИНГ РНК У ПРОКАРИОТ Псевдоуридин -  Различные этапы образования зрелой тРНК из предшественника (тРНК Tyr E. coli ) Типичные кластеры генов тРНК E. coli и их первичные транскрипты В определенных позициях у всех тРНК находятся модифицированные основания CCA- добавляющая полимераза РНКза P РНКза D

Изображение слайда
15

Слайд 15

163.5 Schematic diagram of T. maritima RNase P RNA. b, c, Sequence and secondary structure diagrams of the P RNA showing major interactions observed in the crystal structure. Filled circles represent non-canonical base pairing; dashed lines correspond to other types of interactions; arrows indicate 5 ’ to 3’ direction; and lines linking boxed nucleotides represent tertiary interactions. Shaded boxes correspond to regions in the smaller of the two layers.

Изображение слайда
16

Слайд 16

163.6 Model of RNase P–tRNA interactions

Изображение слайда
17

Слайд 17

Изображение слайда
18

Слайд 18

Различные этапы образования зрелой тРНК из предшественника (тРНК Tyr E. coli )

Изображение слайда
19

Слайд 19

L- конфигурация тРНК Structure of the class I CCA-adding polymerase and tRNA minihelix complex. a, Overall structure. b, Recognition of the tRNA T Y C-loop by the tail domain. c, Recognition of 39-terminus of RNA at the catalytic site. Nomenclature of the nucleoside positions in the catalytic cleft is shown. d, Recognition of the tRNA acceptor/T Y C helices by the enzyme neck (green) and body (yellow) domains.

Изображение слайда
20

Слайд 20

Schematic of the mechanism of CCA-adding dynamics. Throughout the reaction, the enzyme tail domain anchors the tRNA TΨC-loop to prevent its translocation. For the first CMP incorporation, the tRNA acceptor stem expands to fit the discriminator directly into the active site, and snaps back. The first and second CMP incorporations are driven by an “open” to “closed” transition of the polymerase head domain. In contrast, the final AMP incorporation is directed by the locked active-site structure. Dissociation of the pyrophosphate byproduct reopens the gate and the mature tRNA is released.

Изображение слайда
21

Слайд 21

Expansion and contraction of the primer RNA helix at the mini-D stage. a, Extended structure at the mini-D stage in schematic representation. b, Contracted structure at the mini-DC and other stages in schematic representation.

Изображение слайда
22

Слайд 22

67 ГЕНЕТИЧЕСКИЙ КОД Аминокислотная последовательность белков соответствует нуклеотидной последовательности кодирующих их генов тРНК играет роль адаптера между нуклеиновой кислотой и белком Аминоацил-тРНК - синтетазы связывают одну-единственную аминокислоту с одной или несколькими родственными тРНК Гентический код избыточен (вырожден) Гентический код универсален (5’) (3’)

Изображение слайда
23

Слайд 23

ГЕНЕТИЧЕСКИЙ КОД 67.5

Изображение слайда
24

Слайд 24

68.5 ГЕНЕТИЧЕСКИЙ КОД ВОТ КОТ ТОМ ТОМ ЕЩЕ МАЛ УХО УСЫ НОС В ОТК ОТТ ОМТ ОМЕ ЩЕМ АЛУ ХОУ СЫН ОС ВО ТКО ТТО МТО МЕЩ ЕМА ЛУХ ОУС ЫНО С Мутации со сбивкой и восстановлением рамки считывания ВОТ КОТ Т A О МТО МЕЩ ЕМА ЛУО УСЫ НОС Вставка A Делеция Х Для любой полинуклеотидной последовательности существует альтернативный набор триплетов, или рамок считывания

Изображение слайда
25

Последний слайд презентации: 56 ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ Основные положения ДНК-зависимая РНК-полимераза Регуляция

68 ГЕНЕТИЧЕСКИЙ КОД Открытая рамка считывания (open reading frame, ORF )   - протяженная последовательность нуклеотидов от стартового до стоп кодона, т.е. потенциально способная кодировать белок

Изображение слайда